Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9Y3F1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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