Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms