Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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USP18Q9UMW8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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USP18Q9UMW8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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USP18Q9UMW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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USP18Q9UMW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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USP18Q9UMW8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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USP18Q9UMW8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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USP18Q9UMW8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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USP18Q9UMW8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP18Q9UMW8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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