Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms