Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP4Q9UKK3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms