Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms