Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA4Q9UI42 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms