Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXTL2Q9UBQ6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXTL2Q9UBQ6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms