Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINM1Q9NU53 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINM1Q9NU53 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms