Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM1Q9NRU3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms