Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPHK2Q9NRA0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms