Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms