Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF541Q9H0D2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF541Q9H0D2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF541Q9H0D2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF541Q9H0D2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF541Q9H0D2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF541Q9H0D2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms