Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIPCQ9C0C6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIPCQ9C0C6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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