Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms