Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms