Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALPK3Q96L96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms