Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD4Q96KN9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJD4Q96KN9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD4Q96KN9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD4Q96KN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD4Q96KN9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD4Q96KN9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD4Q96KN9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms