Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF2Q96GP6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms