Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIRT1Q96EB6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIRT1Q96EB6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms