Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO1Q92973 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO1Q92973 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms