Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD50Q92878 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms