Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms