Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms