Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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