Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF169Q8NCN4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF169Q8NCN4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms