Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC24Q8N4L8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC24Q8N4L8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms