Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LTBP4Q8N2S1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTBP4Q8N2S1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms