Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRNP1Q6NT89 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms