Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS3Q68E01 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms