Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRNL1Q5VV63 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRNL1Q5VV63 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms