Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMER1Q5JTC6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMER1Q5JTC6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMER1Q5JTC6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AMER1Q5JTC6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AMER1Q5JTC6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AMER1Q5JTC6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AMER1Q5JTC6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms