Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GREB1Q4ZG55 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GREB1Q4ZG55 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms