Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms