Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM71Q2Q1W2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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