Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPHKAPQ2M3C7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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