Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HADHQ16836 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HADHQ16836 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HADHQ16836 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HADHQ16836 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HADHQ16836 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HADHQ16836 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HADHQ16836 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HADHQ16836 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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