Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN1Q16658 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSCN1Q16658 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms