Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK4Q16654 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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