Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP7Q16576 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP7Q16576 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms