Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3AQ14563 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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