Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms