Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms