Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NCOA4Q13772 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NCOA4Q13772 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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NCOA4Q13772 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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NCOA4Q13772 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA4Q13772 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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