Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXE3Q13461 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXE3Q13461 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXE3Q13461 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXE3Q13461 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXE3Q13461 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXE3Q13461 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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