Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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