Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSRP1Q08945 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms