Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOS1Q07889 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms