Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms