Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNP2Q05952 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms